1966年5月16日，呼和浩特市开始“文化大革命”。1967年，将玉泉区更名向阳区、新城区更名东风区、回民区更名红旗区。同年10月18日，呼和浩特市成立革命委员会取代呼和浩特市人民委员会。1970年10月国务院、党中央军委批准，1971年7月自治区革命委员会通知，将乌兰察布盟（今乌兰察布市）所属土默特左旗、托克托县划归呼和浩特市管辖。1978年10月，红旗区恢复回民区。1979年11月，撤销呼和浩特市革命委员会，恢复呼和浩特市人民政府。同年，东风区恢复新城区。1980年3月，向阳区恢复玉泉区。1995年5月18日，经国务院批准，将乌兰察布盟所属武川县划归呼和浩特市管辖。1995年11月21日，经国务院批准，将乌兰察布盟所属和林格尔县、清水河县划归呼和浩特市管辖。呼和浩特市形成城乡联合、市管旗县的行政区域建制体制。1996年5月18日，乌兰察布盟武川县划归呼和浩特市管辖。呼和浩特市现行政区划共辖9个旗县区，20个街道办事处，96个乡镇，412个居委会和1095个村委会，土地面积17224平方公里。

2000年5月14日，国务院批准调整呼和浩特市市辖区行政区划，郊区更名为赛罕区。

截至2017年底，呼和浩特辖4市辖区（回民区、玉泉区、新城区、赛罕区）、4县（托克托县、清水河县、武川县、和林格尔县）、1旗（土默特左旗）。